常用工具箱

Translate tool – ExPASy 将DNA或者RNA序列转换为对应的蛋白质序列
Antibody Numbering constant 抗体编号系统，恒定区编号。
Antibody Numbering variable 抗体编号系统，可变区编号。
SignalP – 6.0 蛋白质的信号肽位置分析。
Tm calculator – NEB 计算oligo和primer的Tm值
Compute Mw/pI tool 根据蛋白质序列计算理论分子量和等电点值
DNA – reverse and complement 将DNA序列反转、互补或者大小写转换
Back Translation 将蛋白质序列转换为人源或者细菌源DNA
Bacteria Codon Usage Frequency 细菌E. Coli中氨基酸代码使用频率。
MAFFT – DNA alignment DNA序列对比，即DNA alignment
SIM – Alignment Tool for protein sequences 两个蛋白质之间氨基酸序列对比
Sequence Web BLAST BLAST各种DNA、Primer、蛋白质、biomarker序列
Ammonium Sulfate Calculator 硫酸铵沉淀蛋白用量计算器
抗生素常规浓度 抗生素的母液配制以及使用时的培养浓度列表
NEB tools 一系列NEB公司的工具
OligoAnalyzer Tool IDT公司核酸分析工具，可计算siRNA, primer的分子量等参数
GeneArt Instant Designer ThermoFisher的基因序列优化工具
Codon Optimization Vector builder的基因序列优化工具
Codon Optimization Tool IDTDNA的物种基因序列优化工具
Rare Codon Analyzer 稀有密码子分析工具。外网连接后分析较快。
Warwick Calculator
Envipat Calculator		 精确质量计算器，就是计算小分子单同位素峰，也就是丰度最高的分子量加一起，质谱一般看这个。也可以算ppm误差。
Molecular Weight Calculator 摩尔质量计算器，折算入同位素自然相对丰度后的平均分子量。这个网站适用于计算蛋白质质谱的摩尔分子量。